Differensialdiagnosen til primær leverkreft er andre svulsttyper i lever:
- Cystadenokarsinom i intrahepatsike galleganger
- Hepatoblastom (barn)
- Udifferensiert karsinom
- Epitheloid hemangioendotheliom
- Angiosarkom
- Embryonalt sarkom (barn)
- Rhabdomyosarkom
- Metastaser fra andre primærsvulster
Godartede svulster:
- Hemangiomer
- Fibrøs nodulær hyperplasi
- Hamartom (von Meyenburg kompleks)
- Angiomyolipom
Regenerasjonsknuter ved levercirrhose er en annen differensialdiagnose.